Вагинальная флора представлена совокупностью полезных и транзиторных микроорганизмов, находящихся в строгом равновесии: в нормальных условиях полезная флора значительно превышает условно-патогенную.
Приблизительно 95-98% всей вагинальной флоры представлено лактобациллами (палочками Дедерлейна).
Именно лактобациллы (Lactobacillus), разрушая гликоген, вырабатывают молочную кислоту, обеспечивающую кислую среду в вагине и защищающую ее от инфицирования. Оставшиеся 2-5% флоры представлены грамположительными палочками, грамотрицательными кокками, грамположительными кокками, грамотрицательными облигатно анаэробными палочками и энтеробактериями.